Après avoir commencé par des études de piano, Aki Fujitani découvre la flûte à 12 ans.
Diplômée du conservatoire de Kunitachi en 2000, elle passe quatre ans au département de musique des forces terrestres d’auto-défense à Sapporo au Japon. Puis vient la rencontre avec le flûtiste français Jean Ferrandis, qui deviendra son professeur à l’École Normale de musique de Paris. Elle suit également les cours de musique de chambre de M^mes Geneviève Martigny et Nina Patarcec. Elle obtient son diplôme supérieur de flûte et de musique de chambre.
Aujourd’hui, Aki Fujitani se produit essentiellement en France et au Japon. Son répertoire est extrêmement diversifié: de la musique baroque à la musique contemporaine, de Bach, Telemann ou Vivaldi à Fauré, Reinecke ou Piazzolla.
Elle a donné une version très intérieure et très sensible des œuvres de la compositrice japonaise Yuko Uebayashi.
Aki Fujitani se produit avec de nombreux partenaires dont Grégory Foutelet (guitare), Matthieu Cognet, Emi Aoki, Emi Ishii, Noriko Sezaki, Yoko Nakamoto (piano), Yoshie Terasaki, Vincenzo Lai, Mika Takeuji (flûte), Utaco Ichise (violon), Yoriko Okumura (chant)…